새로 들어온 모델

매일 논문과 배포처를 훑어 찾습니다 · 마지막 확인 2026-10-29

이번 주17개

10-29 들어옴NEW

effiedes /

EffieDes

Protein sequence design

단백질 · 서열 설계

★ 4 · 갱신 3개월 전 · 라이선스 미확인

10-29 들어옴 · 도구NEW

xuan13hao /

scPyviewer

scPyviewer: a Python-native interactive viewer from AnnData single-cell data

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-29 들어옴 · 도구NEW

bioinfoliu /

DiDyNet

DiDyNet: a robust framework for differential dynamic network inference from longitudinal multi-omics data.

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-29 들어옴 · 도구NEW

kangk1204 /

MLHeatmap

MLHeatmap: an interactive application for transcriptomic marker-panel discovery.

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-29 들어옴 · 도구NEW

chiu-lab /

DEGEmbedR

An embedding-based framework enables statistical testing of gene-set function hypotheses inferred by large language models.

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴NEW

설명 없음

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴 · 도구NEW

wenlu-lab /

RADAgent

RADAgent: Automating RADseq Pipelines with Private Open-Source LLMs

핵산 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴 · 도구NEW

Cohort Effects, Not Treatment Response, Dominate Public Immunotherapy Cohorts: Evidence from Microbiome and Tumor Genomic Data

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴NEW

gefengya /

MCKcat

Predicting Enzyme Turnover Numbers and Enabling Rational Enzyme Evolution.

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴NEW

weixin7112 /

DFN-kcr

DFN-kcr: a dual-branch deep learning model with attention-guided fusion for predicting lysine crotonylation sites in human non-histone proteins.

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴NEW

A leakage-aware genomic prediction pipeline for meropenem resistance in Klebsiella pneumoniae using transformer-based resistome representation learning.

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-28 들어옴NEW

Cathylixi /

NESS

Uncovering smooth structures in single-cell data with neighbor embeddings guided by predictability-computability-stability.

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-25 들어옴 · 도구NEW

Valdes-Tresanco-MS /

gmx_MMPBSA

Free energy calculation for GROMACS

동역학·물리 · 동역학·시뮬레이션

★ 327 · 갱신 5일 전 · GPL-3

10-24 들어옴NEW

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-23 들어옴 · 도구NEW

kjenike /

panagram

Panagram reveals pangenome architectures underlying trait variation in plants and animals

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-23 들어옴 · 데이터셋NEW

kiharalab /

NuFold

NuFold RNA Structure Database: Large-Scale RNA Tertiary Structure Prediction with Confidence Metrics

핵산 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-23 들어옴 · 도구NEW

4D-Lab /

frame

Fragment-Level Graph Encoding for Interpretable Molecular Property Prediction

저분자 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

지난주4개

10-22 들어옴 · 도구NEW

Digital-Metabolic-Twin-Centre /

gpuGEM

gpuGEM: GPU-based linear optimisation of genome-scale metabolic models

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-22 들어옴 · 데이터셋NEW

lovetaro /

selectbench

On the Selectivity of Generative Models in Structure-Based Drug Design

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-22 들어옴NEW

kasawa1234 /

ProtGlycanDock

ProtGlycanDock: Towards Accurate Protein-Glycan Docking with Tailored Dataset, Benchmark and Model

저분자 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-17 들어옴 · 데이터셋NEW

daydayup-xq /

CellNet

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10월 9일 – 10월 15일11개

10-15 들어옴NEW

YuX-Ren /

STAMP-V1

설명 없음

저분자 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-15 들어옴NEW

BlueWhaleLab /

PerturbEnergy

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-15 들어옴 · 도구NEW

bioinfodlsu /

DUMMEST

DUMMEST: A simpler and faster model for frameshift-aware alignment of a DNA sequence to a protein family

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-15 들어옴NEW

UgoLomoio /

scHFBiMamba

scHFBiMamba: a bidirectional Mamba autoencoder for cardiac disease-state classification from single-nucleus RNA-seq data

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-15 들어옴NEW

mianqiu00 /

DC-Flow

DC-Flow: Target-Conditioned Cyclic Peptide Design via Delayed-Coupling Flow Matching

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-15 들어옴NEW

octree-nn /

OctMole

OctMole: Multiscale 3D Molecular Generation with Hierarchical Spatial Flows

저분자 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-14 들어옴

dauparas /

LigandMPNN

Computational design of protein conformational landscapes for metamorphic behavior

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ 647 · 갱신 1년 전 · MIT

10-13 들어옴 · 데이터셋

DUAL-Xiao /

MolP2SBench

MolP2SBench: Do LLMs Really Reason from Molecular Properties to Structure?

저분자 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-13 들어옴

bilemond /

ChemDiffAgent

Masked Diffusion Language Agents for Tool-Integrated Chemical Reasoning

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-10 들어옴

Jia040223 /

MAST

MAST: Motif-Augmented Diffusion with Search Tree for Spectroscopic Molecular Structure Elucidation

저분자 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-10 들어옴

PanosAntoniadis /

RAGenome

RAGenome: Scaling Retrieval-Based Genomic Language Models to Long Contexts

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10월 2일 – 10월 8일6개

10-08 들어옴 · 도구

AndolfoG /

HRPv2

HRPv2: an automated and enhanced method for full-length homology-based R-gene prediction

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-08 들어옴

khelverskovp /

Atom-JEPA

Atom-JEPA: Joint-Embedding Predictive Architecture for 3D Atomistic Systems

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-08 들어옴

lokali /

CausalBind

CausalBind: Causal Modeling and Learning for Protein-Molecule Virtual Screening

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-07 들어옴 · 데이터셋

0217ljh /

ColdDDI

ColdDDI: Evaluating Knowledge Utilization in Cold-Start Drug-Drug Interaction Prediction

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

10-03 들어옴

rotskoff-group /

idiom

Disordered protein region language model

단백질 · 표현학습

★ 26 · 갱신 3주 전 · MIT · Curieus

10-03 들어옴

Lyu6PosHao /

RipplePLM

RipplePLM: Structural and Property Decoupling for Protein Mutation Effect Generation

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

9월 25일 – 10월 1일14개

10-01 들어옴 · 도구

Jiadalee /

Mirror-Score

Mirror-Score: Calibrated, Inference-only Scoring Exposes the Limits of Sequence-compatibility Ranking in D-peptide Design

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-30 들어옴 · 데이터셋

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-30 들어옴

QDKStorm /

ProFiT

Flow-Matching-Based Protein Structure Tokenizer Made Efficient and Easy

단백질 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-30 들어옴

Radisen-Panthera /

MoSPR

MoSPR: Histology-to-Gene Expression Prediction with Morpho-Spatial Macrostates and Low-Rank Molecular Programs

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-29 들어옴

UBC-NLP /

GyroNovo

GyroNovo: Error-Guided Fragment Imputation with Mass-Aware Attention for \textit{De Novo} Peptide Sequencing

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴

domenicoscaramozzino /

ENM-BD

설명 없음

단백질 · 동역학·시뮬레이션입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴

iobio-zjut /

TopoFlow

설명 없음

단백질 · 구조 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴

azizilab /

SHERLOCK

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴

GabbyKoki /

Pop-Corn

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴 · 도구

Hoecker-Lab /

mmpbsa-scoring

Predicting single mutation effects on binding affinity at protein-protein interfaces based on MMPBSA calculations

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴 · 도구

rhparry /

sRNAMap

sRNAMap: a lightweight, browser-based web application for small RNA mapping, analysis and visualisation

핵산입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-27 들어옴

rbouckaert /

potts

A first order approximation of a joint Potts and phylogenetic model

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-26 들어옴 · 도구

limengran98 /

CellAudit

설명 없음

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-26 들어옴 · 데이터셋

topu-benchmark /

TopU-LBVS

TopU-LBVS: A Realistic Multi Target Benchmark for Ligand Based Virtual Screening

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

9월 18일 – 9월 24일100개

09-23 들어옴 · 데이터셋

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-22 들어옴

huang-laboratory /

EM3DFold

EM3DFold: accurate de novo protein and nucleic acid model building for cryo-EM maps using language model-powered deep learning

단백질 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-22 들어옴 · 도구

COMBINE-lab /

Gravlax

Gravlax: an annotation-independent molecular evidence archive for single-cell RNA-seq

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-22 들어옴 · 데이터셋

A single-cell RNA-seq catalog of ground truth gene coregulation

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-22 들어옴 · 데이터셋

XieZikai /

RECOB

RECOB: Reliable Benchmarking of Experimental Optimization in Chemistry and Materials Science

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

welch-lab /

LIGER

Single-cell dataset integration and analysis

세포·오믹스 · 오믹스 분석

★ 432 · 갱신 2개월 전 · GPL-3

09-19 들어옴

softnanolab /

BAGEL

Protein engineering via energy landscape exploration

단백질 · 분자 생성

★ 148 · 갱신 2일 전 · MIT

09-19 들어옴

Intelligent-Drug-Discovery-Lab /

OmniSyn

Target-aware synthesizable molecule generation

저분자 · 분자 생성

★ 1 · 갱신 2개월 전 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

coleygroup /

shepherd2

설명 없음

저분자 · 분자 생성

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

math-diff /

gromacs-gamd

Gaussian Accelerated Molecular Dynamics in GROMACS

동역학·물리 · 동역학·시뮬레이션입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

gityuling /

RevPert

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

mindflow-cn /

scDrugPerturb-Bench

설명 없음

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

jbezney61 /

PHAROS

설명 없음

세포·오믹스 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

LucaOne /

LucaCell

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

Balays /

DogMAG

Dog-wise canine gut metagenome assemblies with reconstructed bacterial genomes and viral candidates

핵산입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

szczurek-lab /

OmegAMP

Designing antimicrobials with programmable mechanism and safety

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

PhysiCelldFBA /

PhysiCelldFBA

PhysiCelldFBA: Linking single-cell genome-scale metabolism to spatially explicit multicellular dynamics

세포·오믹스 · 동역학·시뮬레이션입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

Division-resolved inference of flow and trajectories in proliferating cell populations

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

DiLiuLab /

dsRNA-brick

Programmable Self-Assembly of RNA Nanostructures with >100 Unique Components

핵산 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

neginrhm /

panAD-MONET

An Integrated Single-Nucleus Atlas Resolves Cell-Type-Specific Programs and Molecular Subtypes in Alzheimer's Disease

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

SweepLink: Joint Inference of Demography and Linked~Selection from Time-series Data

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

dbjzs /

MAPS

Unifying physical and molecular coordinate systems across modalities in spatial biology

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

ehsanestaji /

VariantFlow

VariantFlow: a selective-execution engine for efficient population genomic computation on large variant datasets

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

MGXlab /

FxTractor

High-throughput genomic feature extraction reveals environmental adaptations of prokaryotes

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

cumbof /

HyperSketch

HyperSketch: de Bruijn graph sketching for genomic similarity estimation with Hyperdimensional Computing

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

JacquemontLab /

gVCF2CNV

gVCF2CNV: a scalable pipeline for CNV detection from whole-genome sequencing data

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

IacopoPasseri /

MErlin

From code to natural language: MErlin - a multiomics toolkit for bacterial epigenomics delivered as Claude agent skill.

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

smuskal /

PharmCast

PharmCast: rapid generation of three-dimensional pharmacophore fingerprints from two-dimensional structure without conformer generation

저분자 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

bigomics /

WGCNA+

WGCNA+: AI-powered WGCNA for Integration of Multi-Omics Data

세포·오믹스 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

EarlhamInst /

EISCA and EISTA

EISCA and EISTA: Full-Spectrum Pipelines for Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analysis

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

BOTANIC-1: a series of long-context plant genomic foundation models in the agentic era

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

KChen-lab /

Monopogen

Single-Cell Indel Detection Enhances Genetic Ancestry and Cellular Lineage Analysis

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

Xuebin-Feng /

EMAP-SSN

EMAP-SSN: An Embedding- and Multiple-Alignment-Integrated Sequence Similarity Network Platform for Interactive Exploration of Protein Sequence Space

단백질 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

SeonghwanSeo /

AtlasFold

AtlasFold: Protein structure prediction with metagenomic-scale language models

단백질 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인 · Curieus

09-19 들어옴

liusihang /

ESMCapsid

Capsid-specialized protein language models reveal higher-order viral architecture from sequence

단백질 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

dhnihaoya /

EvSpark

EvSpark: Lossless Speculative Decoding for Hybrid DNA Foundation Models

핵산 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

YangLabHKUST /

CellART

CellART: a unified framework for extracting single-cell information from high-resolution spatial transcriptomics

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

dannyxbergeron /

NANOCUTSIGHT

NANOCUTSIGHT: A NANOPORE-SEQUENCING APPROACH AND ANALYSIS PIPELINE TO ASSESS GENOME EDITING EFFICACY IN VARIOUS CELL POPULATIONS

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

j-ackierao /

scFLAME

scFLAME: a unified generative model for interpretable clustering, hierarchical structure discovery and marker-gene identification in single-cell RNA-seq data

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

roger-yh-zhao /

PRIS

A Unified Structure-Based Deep-Learning Framework for High-Throughput Screening of Protein-Binding RNAs

핵산 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

wolfsonliu /

bioq

bioq: a unified, agent-native command-line interface to a fleet of AI drug-discovery methods

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

ThorKlm /

PLI-parallax

Predicted and experimental protein-ligand coordinates with distance labels and evaluation splits

저분자 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

ha01994 /

TAPAS

TAPAS: Learned integration of AlphaFold3 confidence and geometric features for TCR-pMHC binding prediction

항체·TCR · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

brooksbenard /

PhenoMapR

PhenoMapR: scalable mapping of sample phenotypes to single-cell, spatial, and bulk transcriptomics data

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

DigBioLab /

odin-multi

Specificity-driven protein binder design with Odin-Multi

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

biolab /

dictyExpress

dictyExpress: an integrated browser for bulk and single-cell Dictyostelium transcriptomics

세포·오믹스 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

AstraZeneca /

GenCDR

Generative Language Modeling for Antibody CDR Grafting and Alignment-driven De Novo Design

항체·TCR · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

HyphAeon: Attention on Evolution Across Deep Time Transforms Comparative Genomics

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

설명 없음

단백질입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

c16267 /

spaCraft

spaCraft: calibrated power analysis and sample-size planning for multi-sample spatial transcriptomics

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

probalytiq /

GOlien tool

GOlien tool: fast and scalable GO term annotation of proteins using a Shannon-entropy k-mer model

단백질 · 기타입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

Rijinna /

scOLAR

scOLAR: Ontology-Anchored Open-Set Annotation of Single-Cell RNA-seq Data

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

giovannellilab /

Geomosaic

Geomosaic: a flexible bioinformatics platform integrating complementary metagenomic analyses from sequencing reads to genomes

핵산입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

kenll99minecart /

SpectroVQ

SpectroVQ: Noise-Aware Compression of Proteomics Data via Vector-Quantized Deep Learning improves MS/MS data storage and Peptide Identification

단백질 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

AngieHinrichs /

viral-usher

Real-time accessible phylogenetics for every highly sampled virus

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

EBI-Metagenomics /

MAP

MAP: a comprehensive pipeline for mobilome annotation and cargo gene characterisation in prokaryotic (meta)genomic assemblies

핵산입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

tslinux /

VARION

VARION: A Network Propagation Framework for Individual Patient Somatic Mutation Interpretation in Cancer Molecular Subtyping

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

dsong-lab /

spAlignDE

spAlignDE unifies cross-sample and cross-modal spatial alignment with mismatch-aware differential expression

세포·오믹스입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

mcjian09 /

SpaCoEx

SpaCoEx: Sparse Gene Selection for Spatially Varying Co-expression in Spatial Transcriptomics

세포·오믹스 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

adamyhe /

pydreg

pydreg: a fast Python package for identifying active cis-regulatory elements from nascent transcription

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

GuoBioinfoLab /

OmniTCR

OmniTCR: a foundation model unifying T cell receptor recognition prediction and conditional sequence generation

항체·TCR · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

Jay-baijie /

PANDA

PANDA: Protein All-atom Nested-tree Denoising Architecture for End-to-End Generation

단백질 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

dina-lab3D /

SABLE

A structural antibody benchmark for leakage-aware deep-learning evaluation

항체·TCR · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

darkest-opson /

ABCP_finder

ABCP_finder: A Transformer Embedding-Based Prediction of Anti-Breast Cancer Peptides

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

PacificBiosciences /

isocall

Isocall enables scalable transcript identification from long-read RNA-sequencing data

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

jianlin-cheng /

TransBind2

TransBind2: Improving Transcription Factor-DNA Binding Prediction with Multimodal Data and Bidirectional Cross Attention

핵산 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

ddzzjj /

ImmuneLens

ImmuneLens: linking transcriptional states and TCR clonotypes through disentangled multimodal learning

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

iobio-zjut /

ForceFlowAb

ForceFlowAb: physics-aware mixture-of-experts flow matching model for antibody CDRs design

항체·TCR · 결합체 설계입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

MALL-Lab /

PRECISION-paper

Heterogeneous graph neural networks with biological prior knowledge for interpretable drug repurposing in triple-negative breast cancer

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 데이터셋

A massively parallel synthetic gene atlas for learning compact cis-regulatory grammar across cellular contexts

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

rahul2512 /

cgNA-plus

Sequence-dependent conformational and mechanical landscapes of double-stranded nucleic acids

핵산 · 동역학·시뮬레이션입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

Peptide structural plasticity is predictable from sequence and environment

단백질 · 구조 예측입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

liskinsk /

RheoScale 2.0

RheoScale 2.0: Revealing the Hidden Roles of Protein Positions via Substitution Patterns

단백질 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

hdlugas /

LevenMap

Novel biologically relevant small RNA-sequencing alignment tool LevenMap for alignment to database of non-coding RNAs

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

OTEAM-AI4S /

NACraft

NACraft: Programmatic nucleic-acid aptamer design via all-atom structure-model feedback

핵산 · 결합체 설계입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

mooreneural /

Lacuna

Lacuna: Cryptic Binding Pocket Discovery via Conformational Ensemble Analysis

단백질 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴

XjunLi /

DuetRNA

Base-and-Sugar Dual-Frame Flow Matching for RNA Co-Design

핵산 · 서열 설계입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

plantomicsgwas1-boop /

PlantOmicsGWAS

PlantOmicsGWAS: An end-to-end, reproducible framework for plant genome-wide association and genomic prediction using linear and pan-genome references

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

Predicting the operon structure of the Mycococcus xanthus genome using the novel software DiscOperon

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-19 들어옴 · 도구

tbaker67 /

ResiRuler

ResiRuler: A Toolkit for Visualizing Residue-Residue Distances and Structural Changes in Biomolecular Models

단백질 · 기타입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

molinfo-vienna /

NEAT-POCKET

Pocket-conditioned 3D molecule generation

저분자 · 분자 생성

★ 7 · 갱신 6주 전 · MIT

09-18 들어옴

molecularmodelinglab /

SABLE

Agentic Bayesian synthesizable ligand exploration

저분자 · 탐색·워크플로

★ 3 · 갱신 8주 전 · Apache

09-18 들어옴 · 데이터셋

afermg /

JUMP-lite

Code and release documentation for JUMP-Lite, a compact, analysis-ready subset of the JUMP Cell Painting dataset for benchmarking cell-image representations.

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ 2 · 갱신 6주 전 · MIT

09-18 들어옴

Luosanj /

VOICE

설명 없음

세포·오믹스 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

whd1125 /

PopPert

설명 없음

세포·오믹스 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

blazejba /

Monroe

Monroe: A Molecular Foundation Model for In-Context Probabilistic Inference

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

GAIR-NLP /

RIBOSPAN

RIBOSPAN: A Long-Context RNA Foundation Model for Versatile RNA Modeling

핵산 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

ecnuabmlab /

CIR-DDG

CIR-DDG: backbone-agnostic residual correction of antibody-antigen affinity changes with explicit cross-chain geometry

항체·TCR · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

graeter-group /

backflip

Predicting directional flexibility in proteins

동역학·물리 · 동역학·시뮬레이션입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

jiankliu /

DSQ

GPCR Ligand Bioactivity Prediction with Physics-Informed Dual-State Query Learning

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴 · 도구

BiodiversityExtinction /

PlainMap

PlainMap: a lightweight, restartable mapping pipeline for ancient and modern DNA

핵산 · 오믹스 분석입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

tansey-lab /

ScreenShot

ScreenShot: A Foundation Model for Few-Shot Combination Drug Screening

저분자 · 탐색·워크플로입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

MengzhouLu /

RetroMPA

RetroMPA: A Molecular Property-Aware Auxiliary Framework for Enhancing Retrosynthesis Prediction

저분자 · 기타입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

littlepeachs /

CoMPASS

CoMPASS: Collaborative Molecular Property Prediction via Adaptive Small-Large Model Synergy

저분자 · 물성·평가입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

kasurl /

LiFT

Language-Informed Flow Matching for Trend-Guided Structure-Based 3D Molecular Generation

저분자 · 분자 생성입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-18 들어옴

developer-hq /

ProbeMatchDTI

ProbeMatchDTI: Probe-Driven Multi-Scale Biochemical Pattern Matching for Drug-Target Interaction Prediction

저분자 · 도킹·상호작용입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

9월 11일 – 9월 17일3개

09-16 들어옴

BaoJiee /

scKITE

설명 없음

세포·오믹스 · 표현학습입출력 미기재

★ — · 갱신 미확인 · 라이선스 미확인

09-14 들어옴

weitse-hsu /

MDArena

AI agent benchmark for MD workflows

저분자 · 탐색·워크플로

★ 9 · 갱신 2개월 전 · MIT